Вынести стили очень просто. Допустим вот у меня есть стиль навигации active, вот тут

и например стиль для карусели

чтобы вынести все стили в отдельный файл, надо создать файлик main.css в папке static

теперь загоняем в main.css содержимое тегов <style>...</style>

теперь убираем сами теги <style>...</style> с содержимым из __layout.html и _navigation.html

теперь подключаем сам файлик через тег link в __layout.html

Ну и собственно все, теперь стили будут браться из файлика main.css =)